崇山寺原为两层大殿，现仅存后殿，建筑形制属清代大木小式硬山青瓦顶五脊式建筑。后殿面阔三间，进深一间，明间阔2.55米，次间均为1.90米，进深5.75米。檐柱四根，柱础覆盆式，金柱八根，檐椽22根。探出大额枋0.55米，飞椽探出檐椽0.28米。椽枋、额垫板均有二龙戏珠、狮子、麒麟、花卉等彩绘纹饰。雀替已不存在。檐柱与金柱间距0.80米，中有抱头梁、穿插梁。寺门上也有彩绘，三架梁与四椽袱间有双步梁。三架梁与四椽袱横跨明间有佛龛，佛龛木质彩绘雕花分为三组，佛龛长2.25米，宽0.74米。后山墙设有供形后门。
室内共有壁画20幅，保存较好。东山墙8幅，山尖脊两倾呈三角形山水人物彩画各一，其下有长方形横幅山水人物画长2.70米、宽0.55米，在横幅两侧有花鸟画，南二幅、北一幅。东山墙金柱前有一幅大型封神演义故事画，长3.50米、宽1.75米，金柱后有一幅两个金刚画像。西山墙与东山墙画幅对称相同。人物各一。北墙后门两侧均有封神演义故事壁画各一，长1.70米、宽1.30米，下有山水画各一，长1.70米、宽0.40米。
殿顶外上为两坡青顶五脊，正脊前后立面有龙雕饰，四条行龙间有花朵雕隔分。龙长0.50米、宽0.15米，花朵长0.40米、宽0.20米，两端均有鸱吻，鸱吻坐下有伸出山墙面背兽（东已不存）。东西垂脊前后顶端都有腰兽，腰兽下各有4个跑兽（现已不存）。山墙基有石条阶，阶上有角柱石，上有石线腰。拔檐上有博风（加博风头一面前后37块）。39个瓦当组成排山沟，墙面花岗岩石座由下线砖往上青砖叠砌，白灰勾缝。
